Raamatupidamiskohustlased on kõik Eestis registreeritud juriidilised isikud ja füüsilisest isikust ettevõtjad ning nad peavad lähtuma Raamatupidamise seadusest. Ettevõtetel on võimalik valida, kas koostada oma aruandeid vastavuses Euroopa Komisjoni poolt vastu võetud rahvusvaheliste finantsaruandluse standarditega (IFRS) või Eesti hea raamatupidamistavaga, mida kirjeldatakse Raamatupidamise Toimkonna juhendites (RTJ). Raamatupidamise korraldamise eest ettevõttes vastutab seaduse ees ettevõtte juht.
Raamatupidamist peetakse Eestis üldjuhul tekkepõhiselt. Tekkepõhine raamatupidamine on majandustehingute kajastamine vastavalt tehingu toimumisele, sõltumata sellest, kas raha on laekunud või välja makstud. Kassapõhist raamatupidamist on lubatud pidada füüsilisest isikust ettevõtjatel. Kassapõhine raamatupidamine on majandustehingute kajastamine vastavalt tehinguga seotud raha laekumisele või väljamaksmisele.
Raamatupidamise korralduse valikul on kriteeriumiteks ettevõtte suurus, tegevusala iseloomust tulenev raamatupidamise maht ja eripära ning juhatuse ja omanike nõudmised aruandlusele. Raamatupidamise korraldamiseks on kolm võimalust: ettevõtte juht teostab ise raamatupidamise, palkab raamatupidaja või ostab raamatupidamisteenuse sisse mõnelt raamatupidamisettevõttelt.
Raamatupidamise korraldamine kätkeb lisaks teostaja valikule ka otsustamist, milline arvestussüsteem on ettevõttele parim. Arvestussüsteem hõlmab nii aruandluse väljatöötamist, sisekorraeeskirjade koostamist kui ka parima tehnilise lahenduse (sh raamatupidamisprogrammi) valikut. Põhinõudeks on aktuaalse, olulise, objektiivse ja võrreldava informatsiooni saamine ettevõtte finantsseisundist, majandustulemusest ja rahavoogudest.